O microscópio é um instrumento que permite visualizar objetos demasiado pequenos para serem observados a olho nu.
Na área da saúde, é utilizado em laboratórios para efetuar diagnósticos a partir de biópsias ou de outras amostras biológicas. De um modo geral, os microscópios são constituídos por um sistema de lentes que ampliam a imagem dos objetos observados.
Há, ainda, microscópios clínicos e/ou cirúrgicos, que são usados para ampliar uma área do corpo do paciente e, assim, permitir ao médico ou cirurgião trabalhar com maior precisão. Utilizam-se no âmbito da microscopia cirúrgica e não serão abordados no presente guia.